Со стороны желудочно-кишечного тракта: тошнота, рвота, кишечная колика, запоры, сухость во рту, глоссит, стоматит, панкреатит, диарея, отсутствие аппетита, неприятный металлический привкус во рту, эпигастральные боли;
Со стороны нейтральной нервной системы: при длительном применении - головная боль, головокружение, нарушения координации движений, атаксия, раздражительность, периферическая невропатия, повышенная возбудимость, депрессии, нарушение сна, слабость; в отдельных случаях - спутанность сознания, галлюцинации, судороги;
Со стороны мочеполовой системы: дизурия, цистит, полиурия, недержание мочи, ощущение жжения в мочеиспускательном канале, избыточное развитие грибковой флоры влагалища (кандидозы);
Дерматологические реакции: аллергические реакции (кожная сыпь, зуд, крапивница);
Со стороны костно-мышечного аппарата: артралгии;
Со стороны кроветворной системы: лейкопения.
Аллергические реакции: заложенность носа, лихорадка;
Местные реакции: тромбофлебит, (боль, гиперемия или отечность в месте инъекции).
Прочие: нейтропения, уплощение зубца Т на ЭКГ.
Во время приема Метронидазола может наблюдаться красно-коричневое окрашивание мочи.