Со стороны системы кроветворения: лейкопения (обычно на 6-15 день, восстановление на 21 день), нейтропения, тромбоцитопения, эритроцитопения, анемия.
Со стороны пищеварительной системы: тошнота, рвота, анорексия, снижение аппетита, диарея, боль в животе, запор, желудочно-кишечные кровотечения, стоматит, повышение активности "печеночных" трансаминаз, нарушение функции печени.
Со стороны сердечно-сосудистой системы: изменения на ЭКГ, тахикардия, аритмии, ишемия миокарда, снижение фракции выброса левого желудочка, хроническая сердечная недостаточность. Токсическое повреждение миокарда, в частности хроническая сердечная недостаточность (ХСН) может развиться как во время лечения митоксантроном, так и через месяцы и годы после окончания терапии. Риск кардиотоксического эффекта возрастает при достижении суммарной дозы 140 мг/м2.
Со стороны органов дыхания: описаны случаи интерстициального пневмонита. Аллергические реакции: кожный зуд, сыпь, крапивница, снижение артериального давления, одышка, анафилактические реакции (в т.ч. анафилактический шок).
Местные реакции: флебит; при экстравазации - эритема, отек, боль, жжение, некроз окружающих тканей. Описаны случаи интенсивного голубого окрашивания вен, в которые вводился препарат и окружающих их тканей.
Прочие: алопеция, повышенная утомляемость, общая слабость, повышение температуры тела, неспецифическая неврологическая симптоматика, боль в спине, головная боль, нарушение менструального цикла, аменорея, голубое окрашивание кожи и ногтей, дистрофия, ногтей и обратимое голубое окрашивание склер, вторичные инфекции, гиперурикемия, гиперкреатининемия.