Препарат обладает антисептическим и широким спектром антимикробного действия в отношении грамположительных (стафилококки, пневмококки, стрептококки) и грамотрицательных (гонококки, менингококки) кокков, коринебактерий, грамотрицательных бактерий (энтеробактерии, псевдомонады), простейших, дерматофитов, дрожжеподобных грибов рода Candida, хламидий, вирусов.
В процессе применения Конъюнктина резистентность микроорганизмов формируются медленно.
Препарат усиливает действие традиционных антимикробных средств при комплексном лечении.