Изониазид, пеницилламин, циклосерин, пероральные контрацептивы, содержащие эстрогены, ослабляют эффект пиридоксина.
Фармацевтически несовместим с витаминами тиамин (В1) и цианокобаламин (В12). Пиридоксин не назначают совместно с леводопой, поскольку ослабляется действие последней.
Усиливает действие диуретиков.
Хорошо сочетается с сердечными гликозидами, глутаминовой кислотой и калия и магния аспарагинатом.
Одновременное применение пиридоксина с циклосерином, этионамидом, гидралазином, азатиоприном, хлорамбуцилом, кортикотропином, циклофосфамидом, циклоспорином, меркаптопурином, пеницилламином - может вызвать анемию и нейропатию.