При взаимодействии с аллопуринолом угнетение ксантиноксидазы, может значительно повысить эффективность и токсичность азатиоприна. Следует избегать комбинирования, особенно при патологии почек, вследствие значительного риска аккумуляции 6-меркаптопурина (метаболит азатиоприна) и повышения его токсичности при развитии отторжения трансплантата. При необходимости комбинирования рекомендуют снижать дозу азатиоприна на 25-33%, тщательно осуществлять мониторинг состояния пациента и коррекцию дозы в зависимости от ответа на терапию и наличия признаков токсичности.
Ввиду иммуносупрессии при использовании азатиоприна может наблюдаться ослабленный иммунный ответ на введение убитых вакцин. Необходимо соблюдать интервал между окончанием лечения и иммунизацией (в зависимости от выраженности иммуносупрессии, вида вакцины и других факторов ― от 3 месяцев до 1 года).
Следует избегать использования живых вакцин во время лечения азатиоприном (нарушение иммунного ответа, повышение вероятности побочных эффектов), а также в течение 3 месяцев - 1 года после окончания лечения (в зависимости от выраженности иммуносупрессии, типа вакцины и иных факторов). Пациентам с ремиссией лейкоза не следует назначать живые вирусные вакцины как минимум в течение 3 месяцев после окончания химиотерапии. Следует отложить иммунизацию живой пероральной вакциной полиомиелита лиц, непосредственно контактирующих с больным.
Активность варфарина может уменьшиться при комбинировании с азатиоприном, может потребоваться повышение его дозы.
Возможен повышенный риск инфекций и развития опухолей при приеме препарата с другими иммунодепрессантами (меркаптопурин, хлорамбуцил, циклоспорин, циклофосфамид).
Может повышаться риск анемии и лейкопении при параллельном применении с ингибиторами АПФ.
Миелодепрессанты, проявляющие предсказуемую дозозависимую миелотоксичность: абакавир, азатиоприн, алдеслейкин, алемтузумаб, алтретамин, амфотерицин B (при системном применении), амфотерицин B липосомальный, анастрозол, бусульфан, валганцикловир, видарабинρ (при системном применении в высоких дозах), винбластин, винкристин, винорелбин, ганцикловир, гемцитабин, гидроксимочевина, дакарбазин, дактиномицин, даунорубицин, диданозин, доксорубицин, доцетаксел, зидовудин, золедроновая кислота, идарубицин, иматиниб, интерферон-альфа, иринотекан, ифосфамид, капецитабин, карбоплатин, кармустин (при системном применении), клозапин, колхицин, ламивудин, ломустин, мелфалан, меркаптопурин, метотрексат, митоксантрон, митомицин, натрия йодид, натрия фосфат, оксалиплатин, паклитаксел, пликамицин, прокарбазин, пэгаспаргаза, стронция хлорид, стрептозоцин, темозоломид, тенипозид, тиогуанин, тиотепа, топотекан, флударабин, флуцитозин, фторурацил (при системном применении), хлорамбуцил, хлорамфеникол, циклофосфамид, цисплатин, цитарабин, эпирубицин, этопозид или лучевая терапия в сочетании с азатиоприном могут вызывать усиление миелотоксичности. При параллельном или последовательном применении двух и более миелодепрессантов, включая лучевую терапию, или лечении ими в анамнезе может потребоваться снижение дозы азатиоприна на основании картины крови.
Возможно усиление миелотоксического действия азатиоприна при параллельном применении с ко-тримоксазолом.
Возможно отторжение трансплантата при параллельном применении рифампицина.
Азатиоприн снижает выраженность миорелаксации, вызываемой недеполяризирующими миорелаксантами, усиливает нервно-мышечную блокаду, вызываемую суксаметонием.
Средства, обладающие непредсказуемой, дозонезависимой миелотоксичностью в некоторых случаях: алемтузумаб, амидопирин, антидепрессанты трициклические, антитиреоидные средства, вальпроевая кислота, производные гидантоина и сукцинимида (антиконвульсанты), дапсон, соединения золота, ингибиторы АПФ, карбамазепин, клозапин, левамизол, локсапин, мапротилин, миртазапин, НПВС (особенно фенилбутазон), пеницилламин, пентамидин, пимозид, примидон, примахин, прокаинамид, пропафенон, пириметамин (в высоких дозах), псевдоэфедрин, пэгинтерферон альфа-2b, ритуксимаб, сульфаметоксазол, сульфаниламиды (при системном применении), сульфасалазин, производные сульфонилмочевины (противодиабетические средства), темозоломид, тиклопидин, тиоксантены, трастузумаб, триметоприм, фелбамат, фенотиазины, флекаинидρ, фоскарнет натрия, хлорамфеникол, цетиризин, эпирубицин при параллельном или последовательном применении с азатиоприном могут вызывать усиление лейкопении и/или тромбоцитопении. Может понадобиться снижение дозы азатиоприна на основании картины крови.
Смешивание со щелочными растворами, особенно при нагревании, может привести к разложению азатиоприна с образованием 6-меркаптопурина. Аналогичный процесс возможен при наличии соединений, содержащих сульфгидрильные группы (цистеин, глутатион, сероводород).