Магалдрат не абсорбируется в желудочно-кишечном тракте (ЖКТ). В процессе нейтрализации - кислоты высвобождаются небольшие, количества ионов магния и алюминия, которые при прохождении через кишечник превращаются в трудно растворимые фосфаты и затем выводится кишечником. Некоторое количество ионов подвергается всасыванию. Было отмечено повышение уровня ионов алюминия в плазме крови даже у пациентов с нормальной функцией почек. Длительное применение препаратов, содержащих алюминий, может вызывать снижение абсорбции фосфатов.