При совместном применении настоя зверобоя с циклоспорином, варфарином, дигоксином, стероидными препаратами, противовирусными средствами - ингибиторами протеазы ВИЧ (ампренавир, индинавир, нелфинавир, ритонавир, саквинавир) возможно снижение их эффективности. Препарат способен усиливать фотосенсибилизирующее действие других лекарственных средств, в т. ч. тетрациклинов, сульфаниламидов, тиазидных диуретиков, хинолонов, пироксикама.